Theo kết luận thanh tra của Thanh tra Chính phủ, dự án Tổ hợp khách sạn căn hộ cao cấp Mường Thanh Nha Trang (60 Trần Phú, TP Nha Trang) có một số vi phạm, cần kiểm điểm trách nhiệm của tổ chức, cá nhân có liên quan. Thời điểm thanh tra, dự án đã được hoàn thành, đưa vào sử dụng.
Theo đó, nguồn gốc đất và tài sản trên đất do Công ty du lịch Khánh Hòa (doanh nghiệp nhà nước) quản lý, sử dụng. Dự án được cấp giấy chứng nhận đầu tư lần đầu vào năm 2012 cho Công ty TNHH Mường Thanh Nha Trang, thuê 4.508 m2 đất.
Tuy nhiên, dự án không đấu thầu lựa chọn nhà đầu tư; không đấy giá tài sản trên đất. Thanh tra xác định Công ty du lịch Khánh Hòa đã cùng góp vốn với Doanh nghiệp tư nhân Xây dựng số 1 tỉnh Điện Biên (Tập đoàn Mường Thanh) thành lập pháp nhân mới để thực hiện dự án (góp vốn bằng giá trị tài sản trên đất). UBND tỉnh Khánh Hòa đã điều chỉnh số tầng (45 tầng nổi, 2 tầng hầm) và Sở Xây dựng cấp Giấy phép xây dựng số tầng nổi là 46 tầng (bao gồm tầng lửng), 2 tầng áp mái, 2 tầng hầm. Điều này vi phạm quy hoạch chung xây dựng TP Nha Trang đã được Thủ tướng phê duyệt năm 2012 (không vượt quá 40 tầng).
Thanh tra Chính phủ cho rằng chịu trách nhiệm về các vi phạm, sai sót trên là Chủ tịch UBND tỉnh và Phó Chủ tịch UBND tỉnh có liên quan; Giám đốc các sở ngành: Kế hoạch và Đầu tư; Tài nguyên và Môi trường; Tài chính; Xây dựng; UBND TP Nha Trang và các tổ chức, cá nhân liên quan.
Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng chỉ đạo UBND tỉnh Khánh Hòa có biện pháp quản lý hiệu quả việc sử dụng phần vốn có nguồn gốc là tài sản của doanh nghiệp nhà nước đã góp vốn; không để thất thoát vốn; xác định lại tiền sử dụng đất, tiền thuê đất khi dự án có nguồn gốc trước đây do doanh nghiệp nhà nước quản lý.
Đồng thời, Thanh tra Chính phủ kiến nghị xử lý vi phạm về số tầng xây dựng vượt quy hoạch do Thủ tướng phê duyệt theo quy định; nếu được, Thủ tướng đồng ý cho phép điều chỉnh quy hoạch cục bộ TP Nha Trang thì thu tiền sử dụng đất bổ sung.